Le Comité d'orientation est chargé de définir la politique générale en matière de biodiversité et de veiller à la coordination des interventions des différents ministères signataires et des organismes publics placés sous leur tutelle. Il décide également des modalités d’évaluation des activités du groupement.
Composition
Il est présidé par le président du Conseil du Groupement, Jean-Claude Lefeuvre. Il réunit les représentants des différents ministères membres du Groupement :
le Directeur de la recherche au Ministère chargé de la recherche, ou son représentant,
le Directeur de la coopération scientifique, universitaire et de la recherche au Ministère chargé de la coopération, ou son représentant,
le Directeur général de l'industrie, des technologies de l'information et des postes au Ministère chargé de l’industrie, ou son représentant,
le Directeur général de l'enseignement et de la recherche au Ministère chargé de l'agriculture, ou son représentant,
le Directeur des études économiques et de l'évaluation environnementale du Ministère chargé de l'environnement, ou son représentant.